Действие развивается в самом начале манги. Виктория уже вампир, но нападение Валентайнов на особняк Хеллсинг все еще не состоялось и пока только планируется.

Со времен легендарного охотника на вампиров, профессора Ван Хелсинга, тайная организация Королевский Протестантских Рыцарей, унаследовавшая имя своего основателя — «Хеллсинг», успешно сражается с вампирами, оборотнями и прочей нечистью, на берегах туманного Альбиона. Сейчас во главе организации стоит хладнокровная Интегра, правнучка Ван Хелсинга.
Именно ей предстоит вести настоящую войну с порождениями загадочных врагов человечества, превращающих людей в «искусственных упырей». Эпидемия распространяется с ужасающей скоростью и начинает угрожать существованию самой организации Королевский Протестантских Рыцарей. В час, когда отступают отряды элитного спецназа «Хеллсинга», единственной надеждой Интегры остается могущественный истинный вампир Алукард, вынужденный служить своим новым хозяевам — людям.
Речь идёт об организации Хеллсинг, чьим основателем стал знаменитый Абрахам Ван Хеллсинг. Естественно, организация продолжает славное дело основателя: уничтожать вампиров. Но что-то странное начинает происходить: вампиров становится всё больше, и они не такие, как обычно. Тут в дело вступает Алукард, вечно скучающий и жаждущий битвы с сильным противником, носферату, гуляющий в ночи. Истинный вампир. Вампир, прирученный людьми, и подвергшийся опытам, в результате которых стал практически непобедимым, но подвластным людям. Его хозяйкой становится молодая глава организации: Интегра Уингейтс Хеллсинг.